サーバへのアクセスが出来ない場合は、挙動に関するカスタマイズは難しいかと思います。
サーバのコントロールパネルが別途用意されていて、FTPアカウントの設定などは出来ないレンタルサーバでしょうか？
今後、サーバへの接続が出来ないままだと困る事もあるかもしれませんので、可能であれば、ご利用中のサーバ屋さんのサポートに問い合わせされてみては如何でしょうか？
（セキュリティ的な観点から本来ならお願いしていた会社と連絡が取れなくなった時点でパスワードを変更する等の対応をしておいたほうが良かったかと思います）

ECCUBEの挙動のカスタマイズは、
phpプログラムの変更が必要となるのですが、記述を誤るとサイトがエラーで動かなくなる可能性もあります。
今後、ご自身のカスタマイズを進められていくのであれば、出来るだけ変更前のファイルをコピーして残しておき、
何かあれば、そのファイルで元に戻せるようにしておけば、いざという時にも困らなくて済むかと思います。

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株式会社シロハチ
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