ありがとうございます。
また、お返事が遅くなり申し訳ありません。

ご指摘いただいた通り、両プラグインの連携がされていないようでしたが、
カード決済まわりに手を加えるのは避けたかったので、
定期的に plg_coupon_orderのorder_dateとplg_couponのplg_coupon.coupon_use_timeを
更新するSQLをバッチ処理で適用することにいたしました。

リアルタイム反映ではないので、タイミングによっては続けてクーポン使用ができてしまいますが、
クーポン配布時に1回のみの利用と明記した上で、運用でカバーいたします。