あまりスマートではないですが、表示している商品詳細ページと同じタグが登録された商品の一覧表示用データを取得しています。

$product_tag_ids = array();
foreach ($Product->getProductTag() as $ProductTag) {
$Tag = $ProductTag->getTag();
array_push($product_tag_ids, $Tag->getId());
}

$qb_ext = $this->entityManager->getRepository('Eccube\Entity\Product')->createQueryBuilder('p');
$qb_ext ->innerJoin('p.ProductTag', 'pt')
->innerJoin('pt.Tag', 't');
foreach ($product_tag_ids as $key => $val) {
if ($key == 0) {
$qb_ext ->where('t = ' .$val);
} else {
$qb_ext ->orwhere('t = ' .$val);
}
}
$qb_ext ->orderBy('p.create_date', 'desc');

$Products_ext = $qb_ext->getQuery()->getResult();

where句の指定で、配列から複数条件を指定する方法がわからなかったため、上記のようにしています。
setParameterで指示する事も考えましたが、こちらで進めようと思います。