taka.takaです。
私もmiyazaki様と同様に4.0.2へのアップデートプラグインを試しました。
テスト環境では全く問題なくアップデート処理が終了し、PHP7.3.6に変更後も管理画面にログインできました。

しかし本番環境でアップデートを行った所、ソースのアップデート処理の途中あたりでシステムエラー画面(焦っていたのでログを保存するのを忘れました）になってしまいました。
その後、管理画面でシステム情報を見るとEC CUBEのバージョンは4.0.2と表示されており、PHP7.3.6に変更しても管理画面にログインできるので、エラー画面が表示されても処理は正常に終了しているのかもしれません。
ただ、テスト環境でアップデートした際にはソースコードの更新処理の後にデータ更新を実行するというボタンを押したのですが、本番環境ではその前にエラーになってしまった為、データ更新の処理が行われていないような気がします。
何かログがサーバー上に残っていて、すべての処理が正常終了しているのか確認する方法はあるでしょうか？
ご存知の方がいらっしゃいましたら教えてください。

よろしくお願い致します。