h_tanaka様
早速ご回答くださいまして誠にありがとうございました。

1）
app/Plugin/SlnPayment/Service/MailService.php（55行目）
$this->app->mail($message); の直前に次を追記。
上記の場所に追記しました。

2）
app/Plugin/SlnPayment/Controller/PaymentController.php（402行目）
$app['session']->set($this->sessionOrderKey, $Order->getId()); と
$app['eccube.service.shopping']->sendOrderMail($Order);の間に

$app['eccube.service.shopping']->notifyComplete($Order);　を追加しました。


上記内容でカード決済の場合でもポイントが無事に動くようになりました！！！！！！！！！！
(もし、上記以外にも他の箇所に修正を加える必要がございましたらご指摘いただけますと嬉しいです。)

お手を煩わせてしまい誠に申し訳ございませんでした。
感謝いたします。
どうぞよろしくお願いいたします。