サーバ側の設定が間違えていたということで、とりあえず直りました。
障害発生原因も内容もわからないままでは困るので、引き続き確認していますので、報告を貰ったらシェアさせていただきます。

‥といいつつ、さくらインターネットのカスタマーサポート。
上記調査対応してくれた人と最初の問い合わせから引き続き返事対応している人は別なのですが、対応後なのに後者のスタッフはまだサポート外だと言い張った返信を寄越してくる。
サーバの問題なのに、こんなカスタマーサポートの１スタッフが門前払いにするせいで解決しないってこともあるんですね。