＞受注データの合計金額、受注明細データの金額は変わってはいません。
という事であれば、オプション料金の再計算を行う想定ではなさそうですね。
そうであればplg_productoption_dtb_order_optionテーブル等は変更しないほうが良さそうな気もしますが
単純に新規注文登録時のロジックと管理画面で注文更新時のロジックが共通化されていて、意図せず更新されてしまっているのかもしれません。

ただ、あくまで私の想像に過ぎませんので
詳しい仕様については、プラグインの配布元に問い合わせされたほうが良いかと思います。

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株式会社シロハチ
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