tsuji様

ご助言頂いている意味が理解できました。

dumpの結果から tsuji様の考え通りの挙動で、ご指摘の通り {{tree(Category.children)}}することがわかりました。
ご指摘の通り今のままでは「idやnameの中身」がChildCategoryになるからです。

ご助言をようやく理解した上で、修正して実行すると
Key "children" for array with keys "id, name" does not exist in __string_template__078dd8f837f68751123bf23bd9477b2ab0c382ded78f8c99f0f3134ab92dd434 at line 6.
上記のようなエラーがでました。

{{dump(Category.children)}}にすれば
array:2 [▼
"id" => 1
"name" => "taro"
]

が表示されたので上書きで{{tree(Category.children)}}としたのですが前述のエラーになりました。

もし、なにか思い当たることがあればよろしくお願いいたします。

コントローラー側を
class SampleController
{
/**
* @Method("GET")
* @Route("/sample/index", name="sample")
* @Template("Sample/index.twig")
*/
public function index()
{

$Categorise = [
["id" => 1, "name" => "suzuki", "children" =>["id" => 1,"name" => "taro","children"=>[]]],
["id" => 2, "name" => "satou", "children" => []]
];
return ["Categorise" => $Categorise];

}
}

twig側を
{% macro tree(Category) %}
{% from _self import tree %}
<a herf="http://localhost?category_id={{ Category.id}}">
{{ Category.name}}
</a>
{% if Category.children|length>0 %}
<ul>
{{tree(Category.children)}}
</ul>
{% endif %}
{% endmacro%}

{% from _self import tree %}

<div class='ec-CategoryNaviRole'>
<div class='ec-itemNav'>
<ul class="ec-itemNav__nav">
{% for Category in Categorise %}
<li>
{{tree(Category)}}
</li>
{% endfor%}
</ul>
</div>
</div>

とすることで解決しました。

tsuji様　アドバイスありがとうございました。