自己解決しました。

テンプレート内に直接PHPを実行している箇所があり、その部分で以下のような記述がある部分がございました。

<!--{php}-->
$_layout = $this->get_template_vars('arrPageLayout');
....
<!--{/php}-->

で、上記の変数が参照できなくなっていただけでした。
こちらを

<!--{php}-->
$_layout = $_smarty_tpl->tpl_vars['arrPageLayout'];
....
<!--{/php}-->

と書き換えして対応できました。