ありがとうございます。

まずdbs.optionsに次の様に追加しました

$this->register(new \Silex\Provider\DoctrineServiceProvider(), array(
'dbs.options' => array(
'default' => $this['config']['database'],
'database2' => $this['config']['database2']
)
));

続いて$options2の定義をしました

$options2 = array(
'mappings' => $ormMappings
);

if (array_key_exists('metadata_cache', $cacheDrivers)) {
$options['metadata_cache'] = $cacheDrivers['metadata_cache'];
$options2['metadata_cache'] = $cacheDrivers['metadata_cache'];

}
if (array_key_exists('query_cache', $cacheDrivers)) {
$options['query_cache'] = $cacheDrivers['query_cache'];
$options2['query_cache'] = $cacheDrivers['query_cache'];

}
if (array_key_exists('result_cache', $cacheDrivers)) {
$options['result_cache'] = $cacheDrivers['result_cache'];
$options2['result_cache'] = $cacheDrivers['result_cache'];

}
if (array_key_exists('hydration_cache', $cacheDrivers)) {
$options['hydration_cache'] = $cacheDrivers['hydration_cache'];
$options2['hydration_cache'] = $cacheDrivers['hydration_cache'];

}


最後にorm.ems.optionsを定義しました


$this->register(new \Dflydev\Silex\Provider\DoctrineOrm\DoctrineOrmServiceProvider(), array(
'orm.proxies_dir' => __DIR__.'/../../app/cache/doctrine/proxies',
'orm.em.options' => $options,
'orm.ems.options' => array(
'default' => $options,
'database2' => $options2,
),

'orm.custom.functions.string' => array(
'NORMALIZE' => 'Eccube\Doctrine\ORM\Query\Normalize',
),
'orm.custom.functions.numeric' => array(
'EXTRACT' => 'Eccube\Doctrine\ORM\Query\Extract',
),
));


コントローラ側では
$db2 = $app['orm.ems']['database2']->getConnection();

$sql = 'SELECT name FROM dtb_xxxx WHERE id in (' . implode($buf, ',') . ')';
$res = $db2->fetchAll($sql, []);

と行ないました。

検索は行えるのですが、向き先がdefaultのDBに接続をされています。

getConnectionで、既に接続済みで、getConnectionはスルーされている様で、一旦DB接続をCloseするか、強制的に再接続を行いたいのですが、何か方法はありますでしょうか？？