早速アドバイスいただきまして誠にありがとうございます。
ご指摘のディレクトリに書き込み権限は付与されていなかったので、パーミッションを変更し、再度試しましたが同じ状況になりアップデートできませんでした。

アップデートする際に選択しなければならないファイルが間違っているのかもしれません。
初歩的な質問で大変恐縮ではございますが、アップデートする際に必要なファイル、またその手順などご教授いただけますと幸いです。