eccubeをインストールした直下に.envという設定ファイルがあり
その中にメールサーバを指定する箇所があります。

以下のリンク先の「3. EC-CUBE4の設定」の項に.envの記述について解説があります。

https://www.mahirokazuko.com/entry/2019/05/15/234746

.envがデフォルトのままだと、WEBサーバ(今回はXserverの機械)からメールが発信されると思います。
その時、送信元メールアドレスにショップ基本設定で指定したメールをセットして発信するのですが
受信時にXserverの機械がG-suitのアカウントで送信してきたと判断してしまい
なりすましメールと判定されているのではないかと思います。

.envでGmailのサーバを指定する事で、Gmailの機械からG-suitのアカウントでメールが発信されるようになり、正規のメールと判定されるようになるかと思います。

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