＞案件の要求が「本体カスタマイズは禁止」でしたので、今回はプラグインのみでの実現を目指しています。
＞正直できるだけお手軽に実装したいと考えています。

という事であれば、尚更、プラグインに対する挙動の変更は実現できないと思います。

どのような形態でサイトを構築されているのか分かりませんが
プラグインの削除の禁止については権限管理の拒否URLでプラグイン周りの操作が行えないようにしておくほうが良いのではないでしょうか？
サイト構築後、保守を継続的に行うのであれば、全ての操作を行える保守用のアカウントを作って、運用上分けて管理する等の形が良いのではないでしょうか？

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株式会社シロハチ
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