その後管理画面に対応していっちょまえに動くようになりました。
（ポイントは使わないので無視　影響あるかないかも見てない）

app/Customize/Controller/Admin/Product/CsvImportController.php
app/Customize/Controller/ShippingMultipleController.php
app/Customize/Entity/ProductClassTrait.php
app/Customize/Form/Extension/Admin/ProductClassEditTypeExtension.php
app/Customize/Form/Extension/Admin/ProductClassTypeExtension.php
app/Customize/Form/Type/Admin/OrderItemType.php
app/Customize/Resource/locale/Eccube/messages.ja.yaml
app/Customize/Service/OrderHelper.php
app/Customize/Service/PurchaseFlow/Processor/TaxProcessor.php
app/Customize/Service/TaxRuleService.php
app/DoctrineMigrations/Version20221017022749.php
app/config/eccube/services.yaml
app/template/admin/product/product.twig
app/template/admin/product/product_class.twig
src/Eccube/Entity/Master/OrderItemType.php
src/Eccube/Entity/OrderItem.php

できるだけsrcいじらずにやったんですけど、
OrderItemType.phpとOrderItem.phpの2つがsrcから出せなかった。。
isProduct()だけならtraitしてEntityProxyServiceゴリゴリして何とかなったんですが、
mtb_order_item_typeに1レコード税込商品を追加したうえでそのEntityに追加するconst部分が無理でした。
public const PRODUCTINCTAX = XX;

とまぁそんな感じなので、この手法でプラグインにするのは厳しいかな（わたしには）。。

個人的にはカスタマイズベースのこれでも十分なので、これをベースに4.1ないしは4.0.6へダウングレード対応させて使っておこうかな。

もし、本体が税込対応するんだったらその動向待つんですけど？？
なんならこれ本体に取り込みます？なんちてw