ご返信ありがとうございます。
うまく伝わってなくて申し訳ないのですが、
独自ドメインの設定は終わってる状況でして、
ロリポップサーバーのサブディレクトリにEC-CUBEを導入し制作し、独自ドメイン設定後に「このページは動作していません　◯◯◯◯.co.jp では現在このリクエストを処理できません。 HTTP ERROR 500」と表示されてページ表示ができない状況でございます。

前回は別サイトにて、ロリポップサーバー直下（サブディレクトリではない場所）で制作した場合はこのようなエラーは出なかったため、ロリポップサーバーのサブディレクトリにて制作したのが原因かと思っておりますが、解決方法がわからず、教えていただきたいと思っております。