引用：

EC-CUBEシステム自体の不具合ではないと思うので、下記の内容で確認してみてください。

1. 直接CSSが設置されているURLアドレスにブラウザでアクセスして読み込みたいファイルの内容は修正等を行ったファイル内容か確認してどうなっていますか？
→正しくファイルがアップロードされていないか、後述する内容に当てはまるかもしれません。

2. CDNサービス等を利用していたりしていませんか？
→CDNサービス上のファイルを更新するか、サーバ管理者に確認してください。

3. レンタルサーバで利用している様ですが、レンタルサーバ側で高速通信の技術でキャッシュを利用していたりしませんか？
→サーバ管理者に確認してください。