とても初歩的な質問なのですが、
サーバーの扱いにあまり慣れていないので、リダイレクトについて、詳しい方の意見をお伺いしたく思います。
よろしくお願いします。

デフォルトのパスは、おなじみ「eccube/html」となっていますが、
これを.htaccessのリダイレクトで、ドメイン直下として表示させたいと思っています。
以下のような感じの記述で、問題なくリダイレクトさせることは可能でしょうか。

RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^domein\.com$ [OR]
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^www\.domein\.com$
RewriteCond %{REQUEST_URI} !^/eccube/html/
RewriteRule (.*) /eccube/html/$1

※やり方を紹介しているサイトから、コピペしてきたもので一部文字化けしてる可能性があります。

管理画面への影響が心配なのですが、eccube/dataの方も何かする必要ってあるんでしょうか？

また色々やり方を探しているときに、
mod_rewriteというのも見つけました。
こちらはhttpd.confをいじらなくてはいけないようで、
あまり慣れていないので触りたくない感じですが、
.htaccessとmod_rewriteでどちらが確実性があるとかいうのはありますか？

例3）mod_rewrite　参照
http://www.rapidsite.jp/support/manual/trialguide/3-2.html