> 一番困っているのは一部の環境でカートに入れるボタンを押すとカートの追加に失敗しましたのアラート、カートに入っても会員登録が出来ないといったトラブルが報告されています。

聞いたことがないトラブルです。

> 4.0.3→4.0.4→4.0.5と短期間でアップデートしたころに隣のPCから管理画面にログインできなくなりました。
> 現在の4.0.6−p2に問題があるのか？お客様の環境によるものなのか判断がつかないでいます。

開発環境などを用意して確認せずに、本番環境をアップデートした為かと思いますが、開発環境を用意した方がよいかと思います。

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