ご確認頂きありがとうございます。

Eccube.Entity.Order.dcm.yml
にstatus として登録されている箇所が３か所あり、そのうち当サイトで使用されていない２か所を削除して解決いたしました。
(削除ではない方法で解決したかったのですが、良い方法が思いつがず)
未カスタマイズ部分なので気が付くのに時間がかかりました。

解決しましたので、こちらのスレッドは閉じさせていただきます。