ありがとうございます。

引用：

そういうデータは確かに存在し、バージョンアップ前はdelf_lagを1にすることで
削除したいデータを非表示にすることができていました。
また、バージョン4へのデータ移行時に、visible=0を設定することで表からは見えませんでした。

visible=0のデータがずっと0のままなら良いのですが、CSV登録のタイミングでvisible=0から1に変わってしまうデータがあるようです


引用：

については、バージョンアップ後に新規で登録した商品（IDの新しい商品）に対しても同様の現象が報告されています。
新しい商品を登録した数日後に在庫変更のタイミングで同じ商品規格のデータが増えてしまうそうです。
（変更前の在庫と変更後の在庫のデータが両方とも見える形で公開されてしまいます）

また、商品CSV登録の項目を追加・変更するようなプラグイン・カスタマイズは行ってなく、デフォルトのCSVフォーマットを使用しています。

色々条件を変えて（わざと重複しそうなCSVを作って）検証しているのですが、手元の開発環境では再現できなかったため、お客さまへのヒアリングを重ねている所です。

似たような事例や対処法をご存知でしたらご教授いただけると幸いです。