えぇと、最初の投稿と同じことを書かなくてもいいですよ（汗）。

Windowsでいうところのシステムの復元みたいに、バキュームで以前の状態に戻ってしまうようだ...　という話なのは理解した上で、

引用：
の意味がわかりません。

繰り返しますが、これは具体的にどこの画面でしょう？
[商品管理]-[商品登録]の[商品カテゴリ]欄で、[登録][削除]をしたときの順番という意味でしょうか？
それとも[商品管理]-[カテゴリ設定]で、親と子の階層関係の話でしょうか？

あと「ユーザーサイド」というのも具体的にどこですか？
カテゴリブロックですか？
商品詳細ページの関連カテゴリ、もしくはパンくずみたいなものを増設しているということですか？