もしかしたら関係ないかもしれませんが、自分も同様の件があり、はまったので投稿します。

■現象
テンプレートで
resize_image.php?・・・
を使っているところでことごとく画像が出ませんでした。

■原因
phpファイルの閉じタグ後に余分に改行が含まれていた。

■修正内容
私の場合は、data/class_extends/db_extends/dbfactory/SC_DB_DBFactory_MYSQL_Ex.phpのファイルのphpの閉じタグを削除しました。


resize_image.php
とこれがincludeしてるファイルのphpの閉じタグ後に余分に改行を含んでいると画像が出なくなりました。
このファイル（正確には、このファイルが使っているphpファイル）はhttpヘッダーを
Content-Type: image/pngにしているためだと思っています。
（httpヘッダーは改行に大きな意味があるため・・・かな？）
私の環境はphpの閉じタグが無くても動くので、カスタマイズしたphpファイルはすべて削除しています。

何か間違いがありましたら、すいませんです。