開発中の2.11.2-devでは、現象が再現出来ませんでした。
2.11.1では、複数配送周りに諸処問題が報告されて色々と細かい修正が多数入っています。

現在作業済み・作業前のものも含め、下記の複数配送関係の不具合・修正チケットを見て頂けると良いと思います。

http://svn.ec-cube.net/open_trac/query?status=assigned&status=new&status=reopened&group=status&summary=~%E8%A4%87%E6%95%B0&milestone=EC-CUBE2.11.2&order=priority

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