決済モジュールを利用していないのであれば、非常に不可解かと思います。

受注データのDBへの登録が完了しなければ、それに対応するメールは送信出来ない仕様です(2.2.0においても）。

となると考えられるのは２つ
1. 間違って受注管理画面で削除してしまった
2. DBサーバー側でデータが飛んだ

1.はphpMyAdmin等でデータベースを直接見ることで確認出来ます。
2.はサーバー会社に確認しないと無理ですね。

繰り返しとなりますが「メールが飛んでいる＝DBに（一時的にでも）データが入った」は間違い無いと思います。

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