自分で解決しました。

問題は<form>タグの場所でした。

<form>タグをPC版と同じように修正して問題なく動作する事を確認しました。



/data/Smarty/templates/sphone/products/detail.tpl


<!--▼CONTENTS-->
<div id="undercolumn" class="product product_detail">
↓追加↓
<form name="form1" id="form1" method="post" action="?">
↑追加↑
<!--★タイトル★-->
<h2 class="title"><!--{$tpl_subtitle|h}--></h2>

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　中略
<!--▼買い物かご-->
↓削除↓
<!--{if false}--><form name="form1" id="form1" method="post" action="?"><!--{/if}-->
↑削除↑
<input type="hidden" name="<!--{$smarty.const.TRANSACTION_ID_NAME}-->" value="<!--{$transactionid}-->" />
<input type="hidden" name="mode" value="cart" />
<input type="hidden" name="product_id" value="<!--{$tpl_product_id}-->" />
<input type="hidden" name="product_class_id" value="<!--{$tpl_product_class_id}-->" id="product_class_id" />
<input type="hidden" name="favorite_product_id" value="" />

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　中略
↓削除↓
<!--{if false}--></form><!--{/if}-->
↑削除↑
<!--▲買い物かご-->

</div>
</div>
↓追加↓
</form>
↑追加↑
<!--詳細ここまで-->
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　中略
</div>
<!--▲CONTENTS-->


上記のように修正して問題なく規格の選択によって価格やポイントが変る事を確認しました。

でも別の問題が発生するかどうかはまだ分かりませんので上記のように修正したい方は十分ご注意してください。